1953年秋，114岁高龄的虚云老和尚从庆云禅寺步行走上云居山，重兴千年祖师道场，传承农禅家风。

2005年，纯闻大和尚继任云居山真如禅寺丈席后，为缅怀虚老发扬虚老德风，亲自主持了对庆云禅寺的修复工作，在庆云禅寺旧址的基础上陆续兴建了大殿、客堂、功德堂、祖师殿、法堂、钟楼、鼓楼等建筑，使之面貌焕然一新。云居山每年五一、十一居士禅修班都会在这里举行。